Bio

Je suis écologiste végétale, passionné par la biodiversité. J’utilise des outils génomiques tels que le génotypage par séquençage et le métabarcoding afin de révéler la diversité, des génotypes jusqu’aux interactions écologiques.

Expérience Professionelle

03-06-2024 - Au présent
Chercheur postdoctoral - Écologie microbienne. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada
Superviseur: Christine Martineau
07-11-2023 - 22-05-2024
Biologiste- Écologie microbienne. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada
Superviseur: Christine Martineau

Formation

2018-2024
Doctorat en Biologie. Université Laval. Québec, Canada
Directeur: Juan Carlos Villarreal Aguilar; Co-directeur: Nicolas Derome.
Recherche: « Évolution et symbiose chez des populations d’une espèce de mousse dans la région subarctique »
2015-2017
Maîtrise en Sciences Biologiques. Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Ville du Mexico, Mexique
Directeur: Claudio Delgadillo Moya
Recherche: « Significado de la reproducción asexual en Calymperes afzelii Sw. y Syrrhopodon incompleuts Schwägr. en el estado de Tabasco »
2008-2014
Baccalauréat en Écologie. Universidad Juárez Autónoma de Tabasco (UJAT). Tabasco, Mexique
Directeur: Ma. Guadalupe Rivas Acuña; Co-directeur: Claudio Delgadillo Moya
Recherche: « Los musgos de la Zona Ecoturística del Ejido Las Flores en Huimanguillo, Tabasco »

Publications

  1. Degenhardt, D., Van Dongen, A., Balaberda, A., Escolástico-Ortiz, D. A., & Martineau, C. (2025). Evaluation of Boreal Plant and Microbe Communities on Tailings Solvent Recovery Unit (TSRU) Tailings: A Meso-Scale Greenhouse Study. Chemosphere, 387, 144662. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2025.144662
  2. Rabearison, T. J., Maire, V., DesRochers, A., Poirier, V., Escolástico-Ortiz, D. A., Morency, M.-J., & Martineau, C. (2025). Phylogenetically related fast-growing trees and their root traits affect soil microbial communities. Applied Soil Ecology, 214, 106389. https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2025.106389
  3. Hernández-Rodríguez, E., Herrera-Paniagua, P., Benítez-Chávez, Á. R., & Escolástico-Ortiz, D. A. (2024). Shedding light on the diversity of epiphytic mosses in some Mexican forests. Botanical Sciences, 102(4), 1265–1283. https://doi.org/10.17129/botsci.3471
  4. Escolástico-Ortiz, D. A., Blasi, C., Bellenger, J.-P., Derome, N., & Villarreal-A, J. C. (2023). Differentially abundant bacteria drive the N2-fixation of a widespread moss in the forest-tundra transition zone. Symbiosis, 90(2), 193–211. https://doi.org/10.1007/s13199-023-00930-y
  5. Escolástico-Ortiz, D. A., & Delgadillo-Moya, C. (2023). Rainfall and gemmiferous shoots influence asexual reproduction in two tropical mosses. Botanical Sciences, 101(3), 713–724. https://doi.org/10.17129/botsci.3252
  6. Escolástico-Ortiz, D. A., Hedenäs, L., Quandt, D., Harpke, D., Larraín, J., Stech, M., & Villarreal A, J. C. (2023). Cryptic speciation shapes the biogeographic history of a northern distributed moss. Botanical Journal of the Linnean Society, 201(1), 114–134. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boac027
  7. Delgadillo-Moya, C., Escolástico-Ortiz, D. A., Herrera-Paniagua, P., Juárez-Martínez, C., Peña-Retes, A. P., & Hernández-Rodríguez, E. (2022). Manual de Briofitas. Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México. (3rd edition). http://www.ibiologia.unam.mx/barra/publicaciones/3a-edicion_Manual-Briofitas.pdf
  8. Rivas-Acuña, M. G., & Escolástico-Ortiz, D. A. (2019). Briofitas. In: La Biodiversidad de Tabasco: Estudio de Estado. Vol. II (pp. 175–177). CONABIO, México. https://www.biodiversidad.gob.mx/region/EEB/estudios/ee_tabasco
  9. Escolástico-Ortiz, D. A., & Juárez-Martínez, C. (2018). Notothylas javanica (Anthocerotophyta: Notothyladaceae): nuevo registro para la brioflora de México. Acta Botanica Mexicana, 123, 183–190. https://doi.org/10.21829/abm123.2018.1287
  10. Rivas-Acuña, M. G., Escolástico-Ortiz, D. A. & Cámara C., L. del C. (2011). Estudio Preliminar de la Brioflora de Tabasco, México. Mesoamericana, 16(2), 185. Stored file in Research Gate

Participations aux conférences

  • 74ème conférence annuelle de la Société canadienne des microbiologistes (SCM-2025)
    17-20 Juin, 2025. Université McGill. Montréal, Canada
    Présentation: « Plant community and species effect on roots and rhizosphere microbiomes in a soil reclamation context ». D.A. Escolástico-Ortiz, A. Samad, D. Degenhardt, M.J. Morency, C. Martineau
  • Journées Centre SÈVE
    14-15 Novembre, 2024. Centre SÈVE. Orford, Canada
    Affiche: « Le rôle des communautés et espèces végétales sur les communautés microbiennes de plantes dans le cadre de la remise en état des sols ». D.A. Escolástico-Ortiz, A. Samad, D. Degenhardt, M.J. Morency, C. Martineau
  • Canadian Society of Soil Science Conference
    9-13 Juin, 2024. University of British Columbia. Vancouver, Canada
    Présentation: « Plant-soil feedback effects on microbial communities in soil reclamation covers ». D.A. Escolástico-Ortiz, A. Samad, D. Degenhardt, M.J. Morency, C. Martineau
  • Colloque du Centre d’Études Nordique
    14-16 Février. University Laval. Québec, Canada
    Affiche: « Accounting for cryptic species uncovers molecular variation in moss clonal populations ». D.A. Escolástico-Ortiz, N. Derome, JC Villarreal
  • Colloque du Département de Biologie
    22-24 Mars, 2023. Université Laval. Québec, Canada
    Présentation: « La fixation d’azote d’une mousse subarctique est façonnée par des bactéries abondantes dans la toundra ». D.A. Escolástico-Ortiz, JC Villarreal, N. Derome
  • Séminaire du Département de Biologie, Ecologie et Evolution
    16 Décembre, 2022. Université de Liège. Liège, Belgique
    Présentation: « Histoire évolutive et fixation d’azote associé avec une mousse nordique ». D.A. Escolástico-Ortiz
  • Réunion de laboratoire de Kathrin Rousk
    8 Décembre, 2022. University of Copenhagen. Copenhagen, Danemark
    Présentation: « Differentially abundant bacteria drive the N2-fixation of a widespread moss in the forest-tundra transition zone ». D.A. Escolástico-Ortiz
  • Séminaire du NEES
    29 Novembre, 2022. Nees Institut für Biodiversität der Pflanzen-Universität Bonn. Bonn, Allemagne
    Présentation: « Evolutionary history and associated biological N2-fixation in a northern distributed moss ». D.A. Escolástico-Ortiz
  • International Association of Bryologists: Bryophytes, lichens, and northern ecosystems in a changing world
    6-9 Juillet, 2021. Université Laval. Québec, Canada
    Présentation: « Elucidating the phylogeographic history and post-glacial demographic signatures of the moss Racomitrium lanuginosum Brid ». D.A. Escolástico-Ortiz, L.Hedenäs, D. Quandt, D. Harpke, J. Larraín, M. Stech & J.C. Villarreal
  • Colloque du Département de Biologie
    22-26 Mars,2021. Université Laval. Québec, Canada
    Présentation: « La spéciation façonne la phylogéographie de la mousse arctique Racomitrium lanuginosum (Hedw) Brid ». D.A. Escolástico-Ortiz, J.C. Villarreal
  • Colloque du Centre d’Études Nordiques
    13-14 Février, 2020. Université McGill. Montréal, Canada
    Affiche: « Phylogéographie de la mousse Racomitrium lanuginosum dans l’Arctique ». D.A. Escolástico-Ortiz, J.C. Villarreal

Bourses et prix

  • Prix de fin d’études
    29 avril 2025. Centre d’Études Nordiques (CEN). Doctorat en Biologie, Université Laval
    400 $ CAD
  • Prix d’excellence en publication
    2 mai 2023. Centre d’Études Nordiques (CEN). Doctorat en Biologie, Université Laval
    300 $ CAD
  • Bourse pour la réalisation d’une formation (Bourse de mobilité)
    31 janvier 2023. Centre d’Études Nordiques (CEN). Doctorat en Biologie, Université Laval
    500 $ CAD
  • Bourse pour cours de perfectionnement
    14 Septembre 2022. Centre d’étude de la forêt (CEF). Doctorat en Biologie, Université Laval
    3,000 $ CAD
  • Stage de Recherche Mitacs Globalik
    Octobre 2022-Janvier 2023. MITACS. Nees Institut für Biodiversität der Pflanzen-Universität Bonn. Bonn, Allemagne
    6,000 $ CAD
  • Stanley Greene Award
    Septembre 2021. The International Association of Bryologists (IAB). Doctorat en Biologie, Université Laval
    750 $ USD
  • Programme de bourses d’excellence pour étudiants étrangers (PBEEE)
    2021-2022. Le Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies et ministère de l’Éducation et de l’Enseignement Supérieur du Québec. Doctorat en Biologie, Université Laval
    25,000 $ CAD
  • Beca Complemento Doctorado - SEP 2018
    2018-2019. Secretaría de Educación Pública (SEP) México. Doctorat en Biologie, Université Laval
    4,480 $CAD
  • Becas del Programa de Fomento, Formación y Consolidación de Capital Humano de Alto Nivel. México.
    2018-2022. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología de México (CONACYT). Doctorat en Biologie, Université Laval
    72,000 $CAD

Stages et formations

  • Les premiers pas en recherche collaborative avec les Autochtones
    5 février 2025. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Atelier
  • L’écogénomique des zones minières pour un nord Canadian durable (GENOSCAN)
    Mai-Octobre, 2022. Université Laval. Québec, Canada.
    Auxiliaire de recherche. Temps partiel
  • Elucidating the evolutionary history of a cold-temperate moss group (Racomitrium sect. Racomitrium) using long read sequence data
    Octobre 2022 - Janvier 2023. Nees Institut für Biodiversität der Pflanzen-Universität Bonn. Bonn, Allemagne.
    MITACS Stage Globalink. Laboratoire: Dietmar Quandt et Julia Bechteler
  • Generalised Linear Mixed Models in R
    26-30 Septembre, 2022. Physalia Courses. Atelier virtuel.
  • Analyses de fixation d’azote et contenu en métaux de mousses
    Mars 2022. Université de Sherbrooke. Sherbrooke, Canada.
    Laboratoire de Jean-Philippe Bellenger
  • Meeting: The Dicranidae Working Group
    6-9 Juillet, 2021. The Dicranidae Working Group. Atelier virtuel.
  • Population Genomics: From Data to Inference
    12-16 Novembre, 2018. Physalia Courses/Université Laval. Québec, Canada.

Encadrement

  • Cours ETE426: Génomique appliquée à l’environnement
    20 Février, 2025. Institut National de la Recherche Scientifique (INRS) - Progrmame d’études gradués. Québec, Canada.
    Présentation: « Métagénomique et microbiome – Utilisation de la génomique pour la recherche dans les laboratoires du gouvernement canadien »
  • Formation Analyses bio-informatiques avec Q2Pipe
    21 mai 2025. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Étudiante au Baccalauréat: Ariadna Chamorro; Projet: « Timmins: Vegetation management effects on the soil microbiome of a boreal mixedwood »
  • Formation Analyses Microbiennes
    1 octobre 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Chercheuse Postdoctorale: Amy-lyn Balaberda; Projet: « Biogeochemical and Microbial Characterization of Froth Treatment Tailings »
  • Formation Extraction d’ADN
    13 mars 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Étudiante au Baccalauréat: Justine Gagne; Projet: «Genomics research for optimization of constructed treatment wetlands for water remediation(GROW) »
  • Formation Analyses Microbiennes
    31 janvier 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Étudiant au Doctorat: Toky Jeriniaina Rabearison; Projet: « Phylogenetically related fast-growing trees and their root traits affect soil microbial communities »
  • Assistant d’enseignement
    Septembre 2022. Université Laval. Québec, Canada.
    Biodiversité I (BIO-1005)
  • Assistant d’enseignement
    Septembre-Décembre, 2021. Université Laval. Québec, Canada.
    Biodiversité I (BIO-1005)
  • Assistant d’enseignement
    Septembre-Décembre, 2020. Université Laval. Québec, Canada.
    Biodiversité I (BIO-1005)

Évaluateur d’articles

  • Global Ecology and Conservation 31 Mars 2025.
  • Revista de Biología Tropical Janvier 2023.
  • Annals of Botany Décembre 2022.
  • The Bryologist Novembre 2022.

Vulgarisation de la science

  • Bryological Times
    13 Juin 2025. International Association of Bryologists.
    Article: «Hide and seek in the tundra: Decoding cryptic diversity in Racomitrium lanuginosum populations»
  • Café Science
    4 Décembre, 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Présentation: «Effets plantes-sol sur les communautés microbiennes dans un contexte de restauration écologique.»
  • L’épopée forestière:125 ans de science CFL
    20-21 Septembre, 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Présentation: «Laboratoire de génomique forestière.»
  • La Pepinière
    Février 2024. Centre de Foresterie des Laurentides, Service Canadien des Forêts, Ressources Naturelles Canada. Québec, Canada.
    Présentation: «Laboratoire de génomique environnementale- Méthode de métabarcoding»
  • Simposio de Briofitas: Conocimiento actual
    25-26 Mai, 2023. Briofitas Latinoamérica. Événèment virtuel.
    Présentation: «La lluvia y los tallos gemíferos influencian la producción de yemas en dos musgos tropicales»
  • Briofitas Latinoámerica - Groupe Scientifique
    2017-Présent. Briofitas Latinoamérica. https://www.facebook.com/BriofitasLatinoamerica/.
    Hernandez-Rodriguez, E.; Juárez-Martínez, C., Rodriguez, L.,… Escolástico-Ortiz, D.A.: «Groupe formé par des étudiants visant à communiquer, à travers les réseaux sociaux et podcasts, des connaissances générales sur les bryophytes dans les pays d’Amérique latine»